28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4087 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  97.24 
 
 		 326 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  70.37 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  35.65 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  34.74 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  32.3 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  31.9 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  33.18 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  32 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  33.16 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  32 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.57 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  35.03 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  25.77 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  33.51 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  33.51 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  33.51 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  26.41 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  32.99 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  32.99 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  32.99 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  32.99 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  32.67 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  29.38 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  27.35 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  29.44 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0877  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.24 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>