97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0414 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0414  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 		 132 aa  273  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1980  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.55 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.83 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6234  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.72 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2936  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.73 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1446  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1360  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2597  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.67 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1094  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0478  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0528952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0205  hypothetical protein  35.59 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1406  hypothetical protein  34.75 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951325  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3212  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0189  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.2 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.2 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.09 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.7 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.08 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1962  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.52 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2179  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.68 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2104  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4408  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.18 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5956  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.71 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.735238  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.29 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  29.79 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4252  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.93 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.66 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.79 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.81 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.93 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1511  hypothetical protein  25.66 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.401586  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.3 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  33.88 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.69 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7100  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.91 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.883539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4517  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.5 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463989  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.77 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1891  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.18 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0984276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.91 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001426  hypothetical protein  27.55 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00259614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.14 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.61 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3405  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.03 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0321  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.457074  hitchhiker  0.00769864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.63 
 
 		 136 aa  47.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1514  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.23 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2783  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.42 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0569406  hitchhiker  0.000528708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.79 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.63 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  27.36 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.07 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5412  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.28 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.72 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.37 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.28 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.19 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3420  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.38 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1286  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.792681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2092  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.07 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0175411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.04 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.52 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.17 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0078  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.94 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.89 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.89 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  30.61 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06309  hypothetical protein  23.71 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.01 
 
 		 137 aa  42  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  24.79 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0877  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.45 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.371874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  23.68 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.55 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.11 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0522  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.37 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.288111  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4168  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.57 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.32 
 
 		 152 aa  40  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 		 136 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28 
 
 		 136 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>