50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1082 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1082  acetyltransferase  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133951  normal  0.398011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1566  acetyltransferase  57.41 
 
 
172 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1370  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
167 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1386  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
167 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  60.96 
 
 
169 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000336085  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1302  GCN5-related N-acetyltransferase  52.94 
 
 
173 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  60.27 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000550882  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2873  GCN5-related N-acetyltransferase  59.03 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  hitchhiker  0.000674869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1409  GCN5-related N-acetyltransferase  55.35 
 
 
172 aa  170  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311178  normal  0.186967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  53.66 
 
 
177 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110989  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  33.04 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  34.83 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  32.64 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3130  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
253 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4349  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.848023  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  45 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  33.77 
 
 
900 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1155  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
264 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
316 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  29.41 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
147 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1353  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
186 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
162 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
157 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4570  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.11 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>