18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2297 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1107  CHAP  57.62 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00855141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0862  CHAP  64 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0244  CHAP domain-containing protein  52.56 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.112542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2738  CHAP domain-containing protein  52.67 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2461  CHAP  45.33 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  54.92 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1018  CHAP domain-containing protein  45.99 
 
 		 162 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1417  CHAP domain containing protein  47.15 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2623  CHAP domain-containing protein  50.79 
 
 		 295 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1081  CHAP domain containing protein  46.56 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2157  CHAP  45.86 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  31.43 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  30.28 
 
 		 266 aa  42  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  34.88 
 
 		 933 aa  41.2  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  29.36 
 
 		 265 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  29.36 
 
 		 265 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2393  hypothetical protein  28.42 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>