16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1107 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1107  CHAP  100 
 
 
161 aa  328  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00855141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2297  hypothetical protein  63.71 
 
 
194 aa  163  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0862  CHAP  58.4 
 
 
245 aa  147  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0244  CHAP domain-containing protein  50.36 
 
 
230 aa  130  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.112542  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2461  CHAP  46.1 
 
 
223 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2738  CHAP domain-containing protein  44.97 
 
 
191 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0703712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1081  CHAP domain containing protein  48.41 
 
 
238 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  48.8 
 
 
222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1018  CHAP domain-containing protein  47.11 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1417  CHAP domain containing protein  46.72 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2623  CHAP domain-containing protein  51.67 
 
 
295 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2157  CHAP  46.62 
 
 
197 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  38.55 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  32.58 
 
 
933 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  36.62 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  36.62 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>