48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1538 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1184    96.22 
 
 		 2430 bp  2163    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    96.46 
 
 		 2292 bp  2189    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    100 
 
 		 2159 bp  2573    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    95.77 
 
 		 1831 bp  2111    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    96.46 
 
 		 2044 bp  2190    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    100 
 
 		 2427 bp  2567    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    93.78 
 
 		 2182 bp  1887    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0968    96.15 
 
 		 2667 bp  2153    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    99.04 
 
 		 1806 bp  1183    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    96.53 
 
 		 2292 bp  2194    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    100 
 
 		 3196 bp  6336    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  78.54 
 
 		 1899 bp  303  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  88.64 
 
 		 1983 bp  95.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  87.5 
 
 		 1983 bp  87.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  97.83 
 
 		 1677 bp  83.8  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  95.65 
 
 		 705 bp  75.8  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  89.47 
 
 		 1881 bp  65.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  85.53 
 
 		 1956 bp  63.9  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  87.5 
 
 		 1977 bp  63.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  87.3 
 
 		 1947 bp  61.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  87.1 
 
 		 2004 bp  60  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  92.68 
 
 		 1971 bp  58  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  96.97 
 
 		 1095 bp  58  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  96.97 
 
 		 1911 bp  58  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  96.88 
 
 		 1977 bp  56  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  89.36 
 
 		 1971 bp  54  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  86.44 
 
 		 1935 bp  54  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  96.67 
 
 		 1926 bp  52  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  96.67 
 
 		 1959 bp  52  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  86.21 
 
 		 1995 bp  52  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  86.21 
 
 		 1995 bp  52  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2833  acetyl-CoA synthetase  96.67 
 
 		 1950 bp  52  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  90.48 
 
 		 1977 bp  52  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  82.93 
 
 		 1983 bp  52  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  90.48 
 
 		 1977 bp  52  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  89.13 
 
 		 1587 bp  52  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  91.89 
 
 		 2013 bp  50.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  90.24 
 
 		 1953 bp  50.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  93.94 
 
 		 1911 bp  50.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  96.55 
 
 		 1923 bp  50.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1153    93.94 
 
 		 1910 bp  50.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00711  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase) (Acyl-activating enzyme)  87.76 
 
 		 1947 bp  50.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  93.94 
 
 		 1911 bp  50.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  93.94 
 
 		 1623 bp  50.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1547b    91.89 
 
 		 4605 bp  50.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  90.24 
 
 		 1953 bp  50.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2725  acetyl-CoA synthetase  91.89 
 
 		 1953 bp  50.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.469585  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>