35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0380 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0968    96.14 
 
 
2667 bp  2151    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.59 
 
 
987 bp  803    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    95.61 
 
 
2292 bp  2900    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.59 
 
 
987 bp  777    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    98.44 
 
 
1806 bp  2018    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.64 
 
 
987 bp  817    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.23 
 
 
987 bp  827    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.23 
 
 
987 bp  827    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1184    96.23 
 
 
2430 bp  2165    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.85 
 
 
987 bp  825    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    100 
 
 
3196 bp  2573    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.64 
 
 
987 bp  817    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0990    96.8 
 
 
471 bp  811    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.657579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    93.8 
 
 
2182 bp  1893    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    100 
 
 
2427 bp  2569    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.69 
 
 
987 bp  856    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    96.17 
 
 
2044 bp  2954    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    95.77 
 
 
1831 bp  2111    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.72 
 
 
981 bp  884    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    100 
 
 
2159 bp  4280    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0144    95.95 
 
 
987 bp  779    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000023312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0102    96.75 
 
 
987 bp  797    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    95.43 
 
 
2292 bp  2916    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1069    96.75 
 
 
408 bp  636  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.85 
 
 
867 bp  605  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0089    98.94 
 
 
294 bp  535  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0942    93.4 
 
 
318 bp  464  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000806031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1537    97.91 
 
 
270 bp  434  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0244114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1758    94.98 
 
 
219 bp  347  8e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0848    97.77 
 
 
366 bp  323  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.103938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1072  hypothetical protein  91.81 
 
 
249 bp  228  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1071  hypothetical protein  94.4 
 
 
141 bp  192  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  97.83 
 
 
1677 bp  83.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  95.65 
 
 
705 bp  75.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  96.97 
 
 
1095 bp  58  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>