20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1184 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0968    96.38 
 
 
2667 bp  2185    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    96.22 
 
 
3196 bp  2163    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1518    98.76 
 
 
1136 bp  1366    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  99.04 
 
 
1125 bp  1384    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    99.08 
 
 
2292 bp  2480    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    97.59 
 
 
1806 bp  1108    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1184    100 
 
 
2430 bp  4817    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  98.9 
 
 
1128 bp  1374    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  98.24 
 
 
705 bp  733    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    95.16 
 
 
2182 bp  2048    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    96.79 
 
 
2427 bp  4189    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0846    99.36 
 
 
474 bp  910    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00867681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0727    98.56 
 
 
715 bp  1291    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000611807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    99.46 
 
 
2044 bp  2518    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    97.69 
 
 
1831 bp  2327    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    96.23 
 
 
2159 bp  2165    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    99.77 
 
 
2292 bp  2549    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1410    84.59 
 
 
327 bp  242  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000109413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  100 
 
 
1677 bp  91.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  100 
 
 
1095 bp  63.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>