35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1362 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0968    97 
 
 
2667 bp  2246    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.12 
 
 
987 bp  977    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    100 
 
 
2292 bp  4544    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.81 
 
 
987 bp  922    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    95.97 
 
 
1806 bp  1822    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.81 
 
 
987 bp  922    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.31 
 
 
987 bp  985    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.75 
 
 
987 bp  961    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1184    99.08 
 
 
2430 bp  2480    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.37 
 
 
987 bp  946    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    96.53 
 
 
3196 bp  2194    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.56 
 
 
987 bp  954    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0990    98.05 
 
 
471 bp  844    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.657579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
867 bp  1057    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    95.23 
 
 
2182 bp  2056    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    96.54 
 
 
2427 bp  2196    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.12 
 
 
987 bp  977    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    98.48 
 
 
2044 bp  3316    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    98.61 
 
 
1831 bp  2422    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.49 
 
 
981 bp  864    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    95.61 
 
 
2159 bp  2900    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0144    96.81 
 
 
987 bp  922    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000023312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0102    98.9 
 
 
987 bp  862    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    99.31 
 
 
2292 bp  2502    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1069    93.87 
 
 
408 bp  611  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1537    99.24 
 
 
270 bp  507  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0244114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0942    93.4 
 
 
318 bp  464  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000806031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0089    94.56 
 
 
294 bp  456  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1758    94.98 
 
 
219 bp  347  9e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0848    97.65 
 
 
366 bp  305  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.103938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1072  hypothetical protein  93.99 
 
 
249 bp  276  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1071  hypothetical protein  94.92 
 
 
141 bp  186  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  100 
 
 
1677 bp  91.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  97.83 
 
 
705 bp  83.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  100 
 
 
1095 bp  63.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>