35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1327 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.37 
 
 
987 bp  793    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.94 
 
 
987 bp  777    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.4 
 
 
987 bp  821    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.4 
 
 
987 bp  821    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1184    97.59 
 
 
2430 bp  1108    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000163066  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1327    100 
 
 
1806 bp  3580    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.15 
 
 
987 bp  785    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.73 
 
 
987 bp  769    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1362    95.97 
 
 
2292 bp  1822    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.26 
 
 
987 bp  839    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0990    96.54 
 
 
471 bp  789    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.657579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0968    99.36 
 
 
2667 bp  1203    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000123752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1538    99.04 
 
 
3196 bp  1183    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00606767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0938    95.85 
 
 
2182 bp  1037    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0912    99.04 
 
 
2427 bp  1179    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.28 
 
 
867 bp  644    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0633    96.61 
 
 
2044 bp  1861    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.061496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0562    97.44 
 
 
1831 bp  1102    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.23 
 
 
981 bp  831    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0380    98.44 
 
 
2159 bp  2018    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0144    95.24 
 
 
987 bp  741    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000023312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0102    96.59 
 
 
987 bp  803    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.01 
 
 
987 bp  817    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0060    95.5 
 
 
2292 bp  1822    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.301658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1758    97.72 
 
 
219 bp  394  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1537    95.12 
 
 
270 bp  392  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0244114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0942    94.72 
 
 
318 bp  385  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000806031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1069    94.56 
 
 
408 bp  371  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0089    93.31 
 
 
294 bp  347  7e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0848    98.32 
 
 
366 bp  331  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.103938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1072  hypothetical protein  91.23 
 
 
249 bp  220  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1071  hypothetical protein  94.4 
 
 
141 bp  192  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1421  hypothetical protein  97.83 
 
 
1677 bp  83.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  95.65 
 
 
705 bp  75.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  96.97 
 
 
1095 bp  58  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>