77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4639 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  65.35 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  47.66 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  53.61 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  40.62 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  40.48 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  40.3 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.107823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  39.06 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  44.09 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  39.78 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  40.16 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  37.01 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  38.64 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  42.39 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4176  hypothetical protein  42.39 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3428  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0728  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.474275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4239  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0741  protein YgiW  37.69 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000152573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4112  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468029  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  37.82 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1979  protein YgiW  39.58 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5364  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00255321  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4923  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00326404  normal  0.0509668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3444  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  36.56 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0413  hypothetical protein  41.05 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  49.21 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04180  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0288  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3532  hypothetical protein  34.83 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0669  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0469  protein YgiW  40 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0729  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.757111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0393  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2451  hypothetical protein  31.43 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5123  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01495  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000630982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01506  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1626  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000207773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5073  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2122  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00124642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1704  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3135  hypothetical protein  32.61 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2152  hypothetical protein  25.98 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4946  hypothetical protein  37.23 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1745  hypothetical protein  26.36 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1628  hypothetical protein  26.36 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000550334  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2109  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1618  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1822  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1627  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1656  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000376444  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1210  hypothetical protein  25.78 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00504058  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1686  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0784  hypothetical protein  29.67 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000115  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>