50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0669 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000115  hypothetical protein  54.2 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0784  hypothetical protein  46.97 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403459  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05723  hypothetical protein  55.04 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  31.11 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  30.94 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3532  hypothetical protein  37.68 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  30.3 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  31.52 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  32.98 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0729  hypothetical protein  28.04 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.757111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  30.23 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.107823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  30.07 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  27.17 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  34.07 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  28.89 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  28.12 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4112  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468029  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5364  hypothetical protein  28.28 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00255321  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  27.5 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3444  hypothetical protein  28.28 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4923  hypothetical protein  28.28 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00326404  normal  0.0509668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  28.79 
 
 		 121 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0728  hypothetical protein  31.96 
 
 		 127 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.474275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04180  hypothetical protein  28.24 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0741  protein YgiW  27.66 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000152573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0413  hypothetical protein  28.24 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  26.8 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  27.55 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  28.38 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>