75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0122 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  65.35 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.107823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  44.62 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  46.09 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  46.09 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  46.09 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  46.09 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  40.94 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  39.57 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  46.46 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  43.65 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  41.73 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  52.63 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  43.16 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  40.3 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  38.3 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  38.76 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  35.16 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4239  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3428  hypothetical protein  32.54 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0728  hypothetical protein  40.82 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.474275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4112  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  35.11 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1979  protein YgiW  36.29 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0288  hypothetical protein  33.63 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4923  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00326404  normal  0.0509668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3444  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5364  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00255321  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  32.56 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0669  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04180  hypothetical protein  41.98 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0413  hypothetical protein  41.98 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  33.7 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3135  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0469  protein YgiW  41.24 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1626  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1704  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1745  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01506  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01495  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000630982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2122  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00124642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3532  hypothetical protein  31.17 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0741  protein YgiW  35.38 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000152573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1822  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1628  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000550334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1656  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000376444  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2109  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1618  hypothetical protein  27.91 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1686  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1627  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2152  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0729  hypothetical protein  30.56 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.757111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2451  hypothetical protein  32.86 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5123  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1210  hypothetical protein  25.86 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00504058  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4946  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0727  hypothetical protein  28.17 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.673173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>