53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1210 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1210  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00504058  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  29.75 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  32.56 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  31.75 
 
 		 117 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  31.16 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  25.6 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  29.92 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3428  hypothetical protein  28.99 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  29.25 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1979  protein YgiW  26.45 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  28.24 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0469  protein YgiW  28.4 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.107823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  29.75 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  28.69 
 
 		 114 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000115  hypothetical protein  31.2 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4176  hypothetical protein  26.32 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  29.82 
 
 		 116 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  27.78 
 
 		 120 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  32.2 
 
 		 114 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4239  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  25.78 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  30.56 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  25.86 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0413  hypothetical protein  28.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04180  hypothetical protein  28.1 
 
 		 116 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05723  hypothetical protein  29.52 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  31.4 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4112  hypothetical protein  27.5 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  32.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1618  hypothetical protein  21.65 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  32.5 
 
 		 117 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1822  hypothetical protein  21.65 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1656  hypothetical protein  21.65 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3135  hypothetical protein  22.45 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1686  hypothetical protein  21.65 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1627  hypothetical protein  21.65 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>