27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0784 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0784  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000115  hypothetical protein  50.41 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05723  hypothetical protein  52.46 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0669  hypothetical protein  46.97 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  32.52 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  34.11 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3444  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4923  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00326404  normal  0.0509668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5364  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00255321  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  37.33 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  37.08 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  41.79 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  35.56 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0741  protein YgiW  28.03 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000152573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0393  hypothetical protein  31.62 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5123  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  29.67 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0288  hypothetical protein  29.36 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  30.08 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4946  hypothetical protein  31.68 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5073  hypothetical protein  33.66 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  28.35 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  29.93 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  30.4 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  29.92 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>