59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5073 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5073  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4946  hypothetical protein  99.13 
 
 		 115 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5123  hypothetical protein  97.39 
 
 		 115 aa  206  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0393  hypothetical protein  93.04 
 
 		 115 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4228  hypothetical protein  61.21 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22850  hypothetical protein  52.29 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0376153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04180  hypothetical protein  62.39 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0413  hypothetical protein  62.39 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  38.79 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  40.87 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  41.82 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  36.13 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  38.39 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  37.61 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5364  hypothetical protein  47.47 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00255321  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4923  hypothetical protein  47.47 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00326404  normal  0.0509668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3444  hypothetical protein  47.47 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476545  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4872  hypothetical protein  46.46 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0425097  hitchhiker  0.000000313008 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0469  protein YgiW  42.71 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  39.78 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4355  hypothetical protein  46.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4176  hypothetical protein  38.53 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3692  hypothetical protein  41.59 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000162961  normal  0.549291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0769  hypothetical protein  41.53 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00945658  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.107823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  37.9 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  37.1 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  38.53 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0741  protein YgiW  41.84 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000152573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0728  hypothetical protein  37.37 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.474275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  38.79 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1979  protein YgiW  33.91 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  43.37 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3428  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0729  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.757111  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  35.04 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4112  hypothetical protein  36.7 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4239  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  34.74 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0288  hypothetical protein  37.84 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3532  hypothetical protein  29.89 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0784  hypothetical protein  39.51 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2451  hypothetical protein  31.62 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>