11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2473 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  48.15 
 
 
168 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  44.71 
 
 
175 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  37.72 
 
 
181 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  42.98 
 
 
250 aa  84.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  43.86 
 
 
250 aa  84.3  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  36.3 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  39.62 
 
 
248 aa  72  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1221  membrane protein  38.38 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  32.69 
 
 
190 aa  42  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>