15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1409 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  96.8 
 
 		 250 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  40.08 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  48.25 
 
 		 168 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1221  membrane protein  32.3 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  50.52 
 
 		 175 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  28.81 
 
 		 181 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  44.23 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  45.24 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  39.42 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  45.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  39.24 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  37.74 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>