16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08330 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  100 
 
 
168 aa  316  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  50.9 
 
 
175 aa  147  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  47.9 
 
 
181 aa  140  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  52.67 
 
 
195 aa  130  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  32.91 
 
 
250 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  48.33 
 
 
248 aa  97.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  42.76 
 
 
198 aa  94.7  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1221  membrane protein  33.33 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  41.58 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  37.96 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  29.66 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  30.77 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  29.2 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  28.15 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  31.86 
 
 
165 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>