12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1065 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  360  6e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  53.16 
 
 
190 aa  189  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  45.6 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  31.37 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  45.57 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  38.46 
 
 
250 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  28.83 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  34.96 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  31.94 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  31.12 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  30.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  27.21 
 
 
181 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>