18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0245 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  381  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  42.08 
 
 
250 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  41.67 
 
 
250 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  38.82 
 
 
248 aa  154  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  43.16 
 
 
175 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  40.91 
 
 
181 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  39.58 
 
 
168 aa  99.4  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  35.11 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  40.62 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  28.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1221  membrane protein  25.78 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  29.94 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  28.27 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  37.04 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  36.89 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  39.34 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  39.34 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>