15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0579 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  475  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  41.32 
 
 
250 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  40.08 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  38.82 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  53.21 
 
 
175 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  48.33 
 
 
168 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  29.2 
 
 
181 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  35.97 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1221  membrane protein  30.23 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  39.62 
 
 
195 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  40.96 
 
 
190 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  34.65 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  34.83 
 
 
196 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  33.06 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  31.36 
 
 
204 aa  42  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>