15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1328 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  100 
 
 		 202 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  34.62 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1518  hypothetical protein  35.79 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000363506  normal  0.716755 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  36.67 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  40.71 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  32.7 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  35.97 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  28.76 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  29.2 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  32.35 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  41.58 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2473  hypothetical protein  35.85 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>