25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1995 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1995  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  799    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3498  protein of unknown function DUF790  32.23 
 
 
405 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3186  protein of unknown function DUF790  31.22 
 
 
452 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0337  protein of unknown function DUF790  30.35 
 
 
405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0330  protein of unknown function DUF790  30.35 
 
 
405 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2122  hypothetical protein  29.47 
 
 
407 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4174  hypothetical protein  30.14 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1761  hypothetical protein  35.57 
 
 
468 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.987591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0952  hypothetical protein  29.45 
 
 
406 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3082  protein of unknown function DUF790  30.54 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0826  protein of unknown function DUF790  27.8 
 
 
404 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.019112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2842  protein of unknown function DUF790  28.68 
 
 
514 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0150518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2642  hypothetical protein  23.73 
 
 
571 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183857  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0662  protein of unknown function DUF790  26.4 
 
 
510 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0648  hypothetical protein  28.84 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.622629  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0339  protein of unknown function DUF790  27.82 
 
 
503 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1481  protein of unknown function DUF790  30.94 
 
 
505 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1456  protein of unknown function DUF790  28.36 
 
 
485 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4976  protein of unknown function DUF790  32.73 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301534  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2025  protein of unknown function DUF790  26.63 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0582  hypothetical protein  26.04 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.566185  normal  0.500457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1431  hypothetical protein  25.07 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.813641  hitchhiker  0.00133471 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1902  hypothetical protein  28.44 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0298  hypothetical protein  26.46 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1190  hypothetical protein  28 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.914671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>