27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0582 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0582  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  954    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.566185  normal  0.500457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1456  protein of unknown function DUF790  43.03 
 
 
485 aa  409  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0662  protein of unknown function DUF790  29.81 
 
 
510 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1761  hypothetical protein  35 
 
 
468 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.987591  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2842  protein of unknown function DUF790  27.75 
 
 
514 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0150518  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0339  protein of unknown function DUF790  27.63 
 
 
503 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2025  protein of unknown function DUF790  29.13 
 
 
528 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1481  protein of unknown function DUF790  29.56 
 
 
505 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1431  hypothetical protein  32.06 
 
 
378 aa  156  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.813641  hitchhiker  0.00133471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2642  hypothetical protein  23.67 
 
 
571 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183857  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1902  hypothetical protein  37.42 
 
 
377 aa  156  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0826  protein of unknown function DUF790  28.74 
 
 
404 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.019112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2122  hypothetical protein  27.12 
 
 
407 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1190  hypothetical protein  35.76 
 
 
377 aa  145  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.914671  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3498  protein of unknown function DUF790  27.16 
 
 
405 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0298  hypothetical protein  36.72 
 
 
384 aa  143  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0952  hypothetical protein  29.45 
 
 
406 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4174  hypothetical protein  28.23 
 
 
404 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0337  protein of unknown function DUF790  26.65 
 
 
405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0330  protein of unknown function DUF790  26.41 
 
 
405 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3082  protein of unknown function DUF790  26.39 
 
 
452 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3186  protein of unknown function DUF790  25.34 
 
 
452 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1995  hypothetical protein  26.32 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4976  protein of unknown function DUF790  25.51 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301534  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0648  hypothetical protein  23.27 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.622629  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0099  hypothetical protein  19.87 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000355367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0231  pyoverdin chromophore biosynthetic protein PvcC  30.65 
 
 
501 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>