25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0648 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0648  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  819    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.622629  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4976  protein of unknown function DUF790  32.33 
 
 
460 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301534  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0337  protein of unknown function DUF790  25.24 
 
 
405 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0330  protein of unknown function DUF790  25.24 
 
 
405 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1995  hypothetical protein  28.91 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2122  hypothetical protein  25.37 
 
 
407 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0826  protein of unknown function DUF790  23.89 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.019112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3498  protein of unknown function DUF790  26.19 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0952  hypothetical protein  26.49 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4174  hypothetical protein  26.51 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0662  protein of unknown function DUF790  26.97 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2025  protein of unknown function DUF790  25.67 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1456  protein of unknown function DUF790  22.47 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3082  protein of unknown function DUF790  24.17 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1761  hypothetical protein  25.94 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.987591  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0582  hypothetical protein  23.1 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.566185  normal  0.500457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2842  protein of unknown function DUF790  25.31 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0150518  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0339  protein of unknown function DUF790  24.42 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2642  hypothetical protein  23.32 
 
 
571 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183857  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3186  protein of unknown function DUF790  23.66 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0298  hypothetical protein  22.37 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1481  protein of unknown function DUF790  24.42 
 
 
505 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1902  hypothetical protein  22.7 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1431  hypothetical protein  23.42 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.813641  hitchhiker  0.00133471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1190  hypothetical protein  25.93 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.914671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>