26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1481 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2842  protein of unknown function DUF790  65.83 
 
 
514 aa  648    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0150518  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1481  protein of unknown function DUF790  100 
 
 
505 aa  984    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0662  protein of unknown function DUF790  62.65 
 
 
510 aa  633  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0339  protein of unknown function DUF790  63.1 
 
 
503 aa  597  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2025  protein of unknown function DUF790  60.71 
 
 
528 aa  578  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1761  hypothetical protein  37.63 
 
 
468 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.987591  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3186  protein of unknown function DUF790  31.15 
 
 
452 aa  170  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3082  protein of unknown function DUF790  30.18 
 
 
452 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0582  hypothetical protein  28.31 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.566185  normal  0.500457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1456  protein of unknown function DUF790  26.38 
 
 
485 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2122  hypothetical protein  28.74 
 
 
407 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0826  protein of unknown function DUF790  29.32 
 
 
404 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.019112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4174  hypothetical protein  29.38 
 
 
404 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2642  hypothetical protein  25.9 
 
 
571 aa  146  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183857  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0337  protein of unknown function DUF790  28.4 
 
 
405 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0330  protein of unknown function DUF790  28.16 
 
 
405 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0952  hypothetical protein  29.61 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3498  protein of unknown function DUF790  28.46 
 
 
405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1902  hypothetical protein  32.25 
 
 
377 aa  131  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0298  hypothetical protein  33.51 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1431  hypothetical protein  30.6 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.813641  hitchhiker  0.00133471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1190  hypothetical protein  32.75 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.914671  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1995  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4976  protein of unknown function DUF790  30.11 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301534  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0648  hypothetical protein  25.39 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.622629  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0099  hypothetical protein  25.23 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000355367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>