25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2642 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2642  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1135    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183857  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0662  protein of unknown function DUF790  28.28 
 
 
510 aa  173  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1761  hypothetical protein  30.69 
 
 
468 aa  163  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.987591  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2025  protein of unknown function DUF790  29.28 
 
 
528 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0339  protein of unknown function DUF790  28.31 
 
 
503 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0582  hypothetical protein  23.67 
 
 
481 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.566185  normal  0.500457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2842  protein of unknown function DUF790  24.22 
 
 
514 aa  144  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0150518  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1481  protein of unknown function DUF790  25.9 
 
 
505 aa  134  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0826  protein of unknown function DUF790  28.67 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.019112 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1456  protein of unknown function DUF790  26.07 
 
 
485 aa  127  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.471447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0337  protein of unknown function DUF790  26.59 
 
 
405 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3498  protein of unknown function DUF790  28.33 
 
 
405 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0330  protein of unknown function DUF790  26.34 
 
 
405 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3186  protein of unknown function DUF790  26.27 
 
 
452 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3082  protein of unknown function DUF790  24.43 
 
 
452 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1902  hypothetical protein  25.31 
 
 
377 aa  118  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4174  hypothetical protein  28.01 
 
 
404 aa  114  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2122  hypothetical protein  26.56 
 
 
407 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0952  hypothetical protein  26.15 
 
 
406 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1190  hypothetical protein  26.77 
 
 
377 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.914671  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1431  hypothetical protein  24.62 
 
 
378 aa  106  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.813641  hitchhiker  0.00133471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1995  hypothetical protein  23.73 
 
 
413 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0298  hypothetical protein  23.58 
 
 
384 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4976  protein of unknown function DUF790  28.3 
 
 
460 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301534  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0648  hypothetical protein  22.68 
 
 
405 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.622629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>