More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0998 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0998  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
341 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.07 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.05 
 
 
342 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1616  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.42 
 
 
355 aa  300  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18154  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.36 
 
 
358 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.66 
 
 
344 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.53 
 
 
347 aa  291  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.25 
 
 
346 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.15 
 
 
350 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.84 
 
 
343 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
331 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.68 
 
 
329 aa  289  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0075  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.18 
 
 
335 aa  289  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496128  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.06 
 
 
340 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3499  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.84 
 
 
343 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.99 
 
 
333 aa  289  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.04 
 
 
345 aa  288  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.44 
 
 
354 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.04 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.41 
 
 
356 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.15 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.99 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.29 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.86 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3150  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.54 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.04 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.92 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.94 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.01 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.24 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0851  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.61 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0951895  normal  0.025674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.94 
 
 
348 aa  281  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.15 
 
 
357 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.26 
 
 
350 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.46 
 
 
347 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.46 
 
 
347 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.34 
 
 
345 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.48 
 
 
352 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.68 
 
 
345 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.46 
 
 
347 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2418  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
329 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.94 
 
 
379 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.27 
 
 
342 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.32 
 
 
363 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.27 
 
 
342 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.59 
 
 
357 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.48 
 
 
345 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.94 
 
 
346 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2582  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
329 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.69072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.6 
 
 
359 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.18 
 
 
346 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.18 
 
 
346 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0516  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.46 
 
 
347 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.706713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.28 
 
 
350 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18610  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
385 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
346 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.03 
 
 
340 aa  277  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.91 
 
 
348 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1636  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.78 
 
 
366 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.85 
 
 
345 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.85 
 
 
333 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.56 
 
 
349 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
348 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.9 
 
 
329 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.99 
 
 
345 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3341  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.74 
 
 
367 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.07 
 
 
328 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.86 
 
 
345 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.32 
 
 
353 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2801  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.38 
 
 
332 aa  275  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840794  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.25 
 
 
352 aa  275  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.62 
 
 
358 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2351  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.41 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.304441  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.85 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.7 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.57 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1573  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.08 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.34 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.74 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1897  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.08 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.9 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  38.97 
 
 
343 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3515  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
370 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.315655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.22 
 
 
350 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.97 
 
 
355 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.07 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.56 
 
 
350 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4388  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.94 
 
 
354 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0414  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.69 
 
 
368 aa  271  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.857995  normal  0.174221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8993  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.18 
 
 
341 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
345 aa  271  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
348 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.16 
 
 
351 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
345 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>