22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0852 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  190  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  36.47 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  39.76 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  31.11 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  34.57 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  31.51 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  26.67 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  25.56 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  25.3 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  25.27 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  26.19 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  30.14 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  28.77 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  25.64 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  39.29 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>