23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0972 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  45.68 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  37.93 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  41.3 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  43.9 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  36.9 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  39.47 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  35.16 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  35.87 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  30.34 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  34.67 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  27.47 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  27.91 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  30.67 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3243  hypothetical protein  26.47 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.989021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2199  coenzyme PQQ synthesis D  25 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000481362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>