25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5035 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  176  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  45.68 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  42.47 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  41.46 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  35.53 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  32.56 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  31.71 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27021  hypothetical protein  25.29 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  33.85 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  32.31 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  32.39 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4647  hypothetical protein  29.63 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3243  hypothetical protein  23.81 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.989021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  28.77 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  32.86 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  30.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  32.53 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>