19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1355 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  37.93 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  42.7 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  36.78 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  41.46 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  34.57 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  34.83 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  30.68 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  30.77 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  27.06 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  29.85 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  30.86 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  32 
 
 
98 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4647  hypothetical protein  28.09 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>