23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4907 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  36.62 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  37.97 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  25.64 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  29.87 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  25 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  27.14 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  29.73 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  26.67 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  34.72 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  27.14 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  30.26 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  25.97 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  28.75 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  31.08 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  28.17 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  31.15 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3243  hypothetical protein  24.36 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.989021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>