18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0892 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  45.12 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  43.9 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  27.59 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2199  coenzyme PQQ synthesis D  34.48 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000481362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  30.12 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  28.17 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  25.27 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2985  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0329429  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  32.93 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>