23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1584 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  40.26 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  40.85 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  37.14 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3985  hypothetical protein  38.1 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.136252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  31.43 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  31.43 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  31.43 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3749  hypothetical protein  36.51 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  32.39 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0626  hypothetical protein  34.92 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000280453  unclonable  0.0000000000695878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27021  hypothetical protein  37.66 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2985  hypothetical protein  37.31 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0329429  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3243  hypothetical protein  29.58 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.989021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1911  hypothetical protein  30.77 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0768  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>