11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3985 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3985  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.136252  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2892  hypothetical protein  34.48 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3749  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0626  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000280453  unclonable  0.0000000000695878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4647  hypothetical protein  28.24 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  39.62 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  32.08 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2370  hypothetical protein  32.05 
 
 
111 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.696423  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0565  hypothetical protein  36.84 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4500  hypothetical protein  30.95 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>