14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1967 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  86.05 
 
 		 86 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  84.88 
 
 		 88 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  26.58 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  27.14 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  28.21 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  33.85 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  25.88 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  26.19 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1584  hypothetical protein  31.43 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  25.68 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  23.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  21.05 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>