27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1028 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  39.47 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  38.27 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  39.24 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  26.83 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  29.63 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1155  hypothetical protein  31.34 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  25.97 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  35.62 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  28.75 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  25.58 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  24.05 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2817  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  26.03 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  24.69 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  31.51 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  25.68 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  26.25 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  23.46 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  28.4 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  23.75 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4715  hypothetical protein  43.86 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.28394  normal  0.611207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  25.64 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  29.85 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2985  hypothetical protein  31.25 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0329429  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4647  hypothetical protein  24.69 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>