17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4547 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4547  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721986  normal  0.107379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  24.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  23.26 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  27.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  28.95 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2985  hypothetical protein  35.37 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0329429  normal  0.223285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14510  hypothetical protein  34.29 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  29.58 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  32.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  22.47 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27021  hypothetical protein  27.54 
 
 		 110 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  29.49 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  22.58 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1594  hypothetical protein  26.58 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>