20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3025 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  206  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  41.3 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  37.97 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5035  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  37.08 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  33.72 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  28.12 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  30 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  32.94 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  26.83 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  26.03 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  31.15 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4500  hypothetical protein  32.86 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27021  hypothetical protein  31.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  22.47 
 
 		 95 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>