24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1465 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1465  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0822  hypothetical protein  37.78 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0048  hypothetical protein  42.7 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1281  hypothetical protein  34.44 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.573383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0852  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3025  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2832  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341973  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0571  hypothetical protein  31.52 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2338  hypothetical protein  29.41 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0805309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1028  hypothetical protein  29.63 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161743  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1967  hypothetical protein  26.58 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.476413  normal  0.278953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0972  hypothetical protein  27.47 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2660  hypothetical protein  27.78 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0210491  decreased coverage  0.0010024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2555  hypothetical protein  28.21 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.924508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0892  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.546821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1214  hypothetical protein  26.92 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566757  normal  0.0801424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4647  hypothetical protein  28.92 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1355  hypothetical protein  30.86 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3243  hypothetical protein  30.91 
 
 		 89 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.989021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4500  hypothetical protein  30.49 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>