46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4816 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  80.27 
 
 		 147 aa  240  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  63.7 
 
 		 170 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  66.67 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  58.7 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  55.47 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.68 
 
 		 832 aa  152  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  53.06 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  52.48 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  51.77 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  51.77 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  55.63 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  57.45 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  57.45 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  57.45 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  57.45 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  54.55 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  46.97 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  43.18 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  43.9 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  42.5 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  41.79 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  40.83 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  39.34 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  36.72 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  46.08 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  40.15 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  43.81 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  36.75 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  45.65 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  36.8 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  36.89 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  36.89 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  34.88 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  31.9 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1094  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>