45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4607 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  89.84 
 
 		 128 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  82.03 
 
 		 128 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  81.75 
 
 		 132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  56 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  52.34 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  46.34 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  52.94 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  51.96 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  52.94 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  40.16 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  38.4 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  37.3 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  39.37 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  38.58 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.84 
 
 		 832 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  36.59 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  36.7 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  36.29 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  36.89 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  36.89 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  35.2 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  33.06 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  32.11 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  39.39 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  36.75 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  34.51 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  33.88 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  31.93 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  30.65 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  32.52 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  34.45 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  34.82 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>