45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1324 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  98.63 
 
 
146 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  98.63 
 
 
146 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  82.88 
 
 
146 aa  258  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  64.34 
 
 
146 aa  195  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  61.38 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  61.38 
 
 
146 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  61.38 
 
 
146 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  61.38 
 
 
146 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  58.04 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  56.74 
 
 
142 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.39 
 
 
832 aa  168  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  56.43 
 
 
142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  55.8 
 
 
143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  59.54 
 
 
147 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  52.48 
 
 
147 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  52.48 
 
 
147 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  52.67 
 
 
149 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  52.21 
 
 
170 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  47.41 
 
 
147 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  40.56 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  41.27 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  40.83 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  37.7 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  38.21 
 
 
128 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  39.2 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  37.8 
 
 
128 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  36.75 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  32.5 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  36.44 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  37.9 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  33.09 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  34.96 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  37.37 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  32.23 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>