45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4357 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  64.86 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  58.7 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  51.02 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  44.85 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  43.18 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  43.18 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  42.98 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  41.6 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  40.74 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  38.3 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  40.15 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.53 
 
 		 832 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  41.27 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  38.97 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  40.48 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  40.48 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  37.23 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  38.84 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  38.17 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  38.14 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  34.55 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  35.34 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  34.19 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  31.36 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  34.21 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  33.04 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  36.89 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  31.5 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>