46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5593 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  353  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  69.18 
 
 
149 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  63.7 
 
 
147 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  63.7 
 
 
147 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  65.28 
 
 
147 aa  185  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  60 
 
 
142 aa  168  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  57.14 
 
 
143 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  57.94 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  56.93 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.48 
 
 
832 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  55.15 
 
 
146 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  51.43 
 
 
147 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  56.39 
 
 
146 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  56.39 
 
 
146 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  56.39 
 
 
146 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  55.64 
 
 
146 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  51.47 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  51.47 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  52.21 
 
 
146 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  47.37 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  41.13 
 
 
128 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  47.32 
 
 
130 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  43.22 
 
 
136 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  44.17 
 
 
148 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  44.95 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  38.64 
 
 
147 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  40.74 
 
 
148 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  39.69 
 
 
132 aa  95.9  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  46.08 
 
 
132 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  46.08 
 
 
131 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  39.69 
 
 
128 aa  90.9  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  41.96 
 
 
130 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  43.56 
 
 
128 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  38.4 
 
 
128 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  36.22 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  37.6 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  36.43 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  35.34 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  44.79 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  30.65 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  36.84 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  36.54 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1094  hypothetical protein  28.28 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>