46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4285 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  64.86 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  62.32 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  46.94 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  47.83 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  45.45 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  44.2 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  44.2 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  37.88 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  39.69 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.02 
 
 		 832 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  37.6 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  36.72 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  36.8 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  37.29 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  35.9 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  36.21 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  36.52 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  34.86 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  34.43 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  36.54 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  35.58 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  35.58 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  31.9 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  30.33 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  31.43 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  31.45 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1654  hypothetical protein  33.72 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>