45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0093 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0093  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1597  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1514  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1274  hypothetical protein  97.26 
 
 
146 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4269  hypothetical protein  65.28 
 
 
146 aa  192  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13101  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1345  hypothetical protein  61.11 
 
 
146 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0864  hypothetical protein  61.11 
 
 
146 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1324  hypothetical protein  61.81 
 
 
146 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2950  hypothetical protein  60.56 
 
 
143 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.49 
 
 
832 aa  183  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2103  hypothetical protein  62.88 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4478  hypothetical protein  58.74 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37150  hypothetical protein  56.83 
 
 
142 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00435317  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4816  protein of unknown function DUF1486  57.45 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734984  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3739  protein of unknown function DUF1486  57.45 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3186  hypothetical protein  55.4 
 
 
142 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0735161  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05451  hypothetical protein  57.04 
 
 
147 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5593  hypothetical protein  56.39 
 
 
170 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1763  hypothetical protein  55.64 
 
 
149 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490407  normal  0.0863406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4422  hypothetical protein  47.06 
 
 
147 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5029  protein of unknown function DUF1486  39.86 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2364  hypothetical protein  39.39 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4357  hypothetical protein  38.17 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5217  hypothetical protein  41.46 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4285  hypothetical protein  38.4 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2784  hypothetical protein  33.87 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.834847  normal  0.19544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2506  hypothetical protein  39.82 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3010  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0418  hypothetical protein  36.75 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0140  hypothetical protein  31.75 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4607  hypothetical protein  32.79 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0803  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3378  hypothetical protein  35.16 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897501  normal  0.125687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1920  hypothetical protein  34.96 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0884  hypothetical protein  30.71 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3147  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2850  hypothetical protein  31.85 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0814  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1416  hypothetical protein  31.15 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000172366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  34.38 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0612  hypothetical protein  30.28 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4979  hypothetical protein  29.03 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5360  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5067  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>