More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4108 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  80.92 
 
 		 567 aa  876    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  74.34 
 
 		 570 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4679  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  75.27 
 
 		 576 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998363  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1515  sulphate transporter  74.64 
 
 		 571 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.020255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  74.87 
 
 		 570 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1715  sulphate transporter  73.65 
 
 		 574 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1461  sulphate transporter  73.43 
 
 		 572 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3995  sulphate transporter  100 
 
 		 573 aa  1124    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437247  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1059  sulphate transporter  74.55 
 
 		 571 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  74.51 
 
 		 570 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4108  sulphate transporter  100 
 
 		 573 aa  1124    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.206174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1421  sulphate transporter  73.98 
 
 		 572 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1539  sulphate transporter  74.55 
 
 		 571 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6179  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  64.66 
 
 		 562 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4635  sulfate transporter  61.92 
 
 		 578 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2661  sulphate transporter  53.52 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955862  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4170  sulphate transporter  43.82 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1050  sulphate transporter  45.03 
 
 		 548 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.089361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0968  sulphate transporter  44.84 
 
 		 548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  34.19 
 
 		 571 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  38.45 
 
 		 583 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.78 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  30.88 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  33.33 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  33.15 
 
 		 572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  32.81 
 
 		 590 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.03 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  30.93 
 
 		 560 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  29.76 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.66 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.26 
 
 		 575 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.88 
 
 		 585 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  31.09 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.33 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  35.44 
 
 		 570 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  33.21 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.64 
 
 		 588 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  29.8 
 
 		 580 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  33.4 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.88 
 
 		 579 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  33.66 
 
 		 556 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  31.87 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.12 
 
 		 578 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  31.67 
 
 		 592 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  33.85 
 
 		 556 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  26.47 
 
 		 573 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.35 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.17 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.38 
 
 		 585 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.05 
 
 		 571 aa  190  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  33.46 
 
 		 551 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  31.63 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  28.88 
 
 		 565 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  28.49 
 
 		 595 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.12 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  34.33 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  28.24 
 
 		 570 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  29.06 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  28.29 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  29.06 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.37 
 
 		 570 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.97 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  32.52 
 
 		 591 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.29 
 
 		 576 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  28.05 
 
 		 568 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.63 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  28.05 
 
 		 568 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  27.62 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.01 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  31.9 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.31 
 
 		 590 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  27.97 
 
 		 568 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  28.76 
 
 		 730 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  29.9 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  31.27 
 
 		 605 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  28.95 
 
 		 574 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  26.9 
 
 		 574 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  28.89 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  31.1 
 
 		 559 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  28.57 
 
 		 585 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  29.61 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.59 
 
 		 575 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.23 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.21 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.79 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.9 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  30.11 
 
 		 605 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.79 
 
 		 585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  27.95 
 
 		 597 aa  157  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  30.81 
 
 		 610 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.79 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.81 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.81 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.81 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.81 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>